Occurrence du polymorphisme de sensibilité intra-croisements à la fusariose chez le palmier à huile au Bénin
Résumé
La fusariose vasculaire est la pathologie la plus dommageable à la production du palmier à huile. Elle est causée par Fusarium oxysporum f. sp. elaeidis. Cette étude vise à déterminer l’occurrence du polymorphisme intra-croisements de sensibilité à la fusariose chez le palmier au Bénin. Une prospection au champ des parcelles expérimentales du Centre de Recherche Agricole Plantes Pérennes (CRA-PP) a été réalisée et les plants ont été observés au champ quant aux symptômes de la fusariose. Des échantillons de sol ont été prélevés pour l’identification de l’agent causal au laboratoire. Parallèlement, un essai a été installé au CRA-PP suivant un dispositif de bloc aléatoire complet comportant 180 croisements / traitements avec 8 répétitions et 20 plants par traitement, soit au total 28.800 plants. Les résultats ont montré que sur les 30 plants adultes évalués aux champs sept présentaient les symptômes externes et 23 ne présentaient aucun symptôme visible. En station, les paramètres morphologiques de caractérisation de la fusariose vasculaire mesurés ont révélé un effet significatif des génotypes (croisements) sur les paramètres mesurés (p <0,05). Il a été établi que le nombre de feuilles par plant, le nombre de feuilles décolorées par plant et le nombre de lésions par plant, caractéristiques de la fusariose sont corrélés avec la coloration du xylème (p < 0,001). De plus, l’analyse de variance révèle des différences significatives entre individus d’un même croisement (variation intra-croisements) pour le nombre de feuilles par plant et la coloration du xylème (p <0,05). Cette variation intra-croisements, suggère un polymorphisme de sensibilité à l’infection. Toutefois les causes génétiques de cette variation peuvent être explorées et exploitées dans les programmes de sélection du palmier à huile pour la résistance à la fusariose.
Références
Appleford NE, Evans DJ, Lenton JR, Gaskin P, Croker SJ, Devos KM, Phillips AL, Hedden P. 2005. Function and transcript analysis of gibberellin biosynthetic enzymes in wheat. Planta 223 (3) : 568-582.
Bal KJ, Suk BG, Parash MM, Bharat B, Devendra G. 2018. Intra-varietal diversity in Landrace and modern variety of rice and buckwheat. The Journal of Agriculture and Environment 19 :1-8.
Barani M, Akbari N, Ahmadi H. 2013. The effect of gibberellic acid (GA3) on seed size and sprouting of potato tubers (Solanum tuberosum L.). African Journal of Agricultural Research. 8(29) : 3898-3903.
Barro-Kondombo C, vom Brocke K, Chantereau J, Sagnard F, Zongo J.D. 2008. Variabilité phénotypique des sorghos locaux de deux régions agricoles du Burkina Faso : la Boucle du Mouhoun et le Centre-Nord. Cahiers Agricultures 17 : 107-113.
Barro-Kondombo CP, 2010. Diversités agro-morphologique et génétique de variétés locales de sorgho (Sorghum bicolor [L.] Moench) du Burkina Faso. Éléments pour la valorisation des ressources génétiques locales. Thèse de doctorat : Université De Ouagadougou.137p.
Bautista-Salas AM. 2009. Caractérisation agro-morphologique et moléculaire d’une collection de landraces péruviennes de pigeonpea (Cajanus cajan L. Millsp.) pour l’analyse de sa diversité. Thèse de doctorat. Faculté universitaire Notre Dame de lapaix. Namur, Belgique. 224 p.
Brocke (vom) K, Presterl T, Christink A, Weltzien E, Geiger HH. 2002. Farmers' seed management practices open up new base populations for pearl millet breeding in a semi-arid zone of India. Plant Breeding 121: 36-42.
Brooks KK, Koen J, Van B, Arni M, Casper WB, Anders N, Hans JS, Maechler M, Bolker M. 2017. glmmTMB balances speed and flexibility among packages for zero-inflated generalized linear mixed modeling. The R Journal 9(2): 378-400.
Buchanan AG. 1999. Molecular genetic analysis of Fusarium wilt resistance in oil palm. PhD Thesis: University of Bath, Bath, UK.
Chochard B, Amblard P, Durand-Gasselin T. 2005. Oil palm genetics and sustainable development. Oleagineux, 12 : 141-147.
Cochard B. 2008. Étude de la diversité génétique et du déséquilibre de liaison au sein de populations améliorées de palmier à huile (Elaeis guineensis Jacq.). Thèse de Doctorat: Montpellier SupAgro.
Corley RHV, Tinker PB. 2003. The oil palm. Blackwell Science Ltd., United Kingdom.
Cooper RM, Rusli MH. 2014. Threat from Fusarium wilt disease of oil palm to South-East Asia and suggested control measures. Journal of Oil Palm Research 26(2) : 109-119.
Cros D. 2014. Étude des facteurs contrôlant l’efficacité de la sélection génomique chez le palmier à huile (Elaeis guineensis Jacq.). Thèse de doctorat. Montpellier, France. 209p.
Diabaté S. 2008. Contribution à l’étude de la diversité phénolique dans la réaction de défense du palmier à huile (Elaeis guineensis Jacq) contre la fusariose vasculaire. Thèse de Doctorat : Université de Cocody-Abidjan, UFR Biosciences. 155p.
Durand-Gasselin T, Blangy L, Picasso C, de Franqueville H, Breton F, Amblard P, Cochard B, Louise C, Nouy B. 2010. Sélection du palmier à huile pour une huile de palme durable et responsabilité sociale. Oléagineux, Corps gras, Lipides, 17(6): 385-392.
Franqueville (de) H, Renard JL. 1990. Bilan de l’amélioration du niveau de tolérance du palmier à huile à la fusariose. Évolution de la maladie sur la plantation R. Michaux. Oléagineux 45(10): 399-405.
Franqueville H, Diabaté S. 1995. La fusariose du palmier à huile en Afrique de l’Ouest. Plantations, Recherche, Développement 2(4): 5-13.
Gonçalves E, Martins A. 2019. Methods for conservation of intra-varietal genetic variability in ancient grapevine varieties. BIO Web of Conferences, 15: 1-4.
Grenier C, Bramel PJ, Dahlberg JA, EL-Ahmadi A, Mahmoud M, Peterson GC, Rosenow DT Ejeta G. 2004. Sorghum of the Sudan: analysis of regional diversity and distribution. Genetic Resources and Crop Evolution 51: 489-500.
Husson F, Josse F, Pagès J. 2010. Analyse de données avec R Complémentarité des méthodes d'analyse factorielle et de classification. 42ème Journées de Statistique, Marseille, France, France. 6p.
Kassambara A, Mundt F. 2017. Factoextra: Extract and Visualize the Results of Multivariate Data Analyses. R package version 1.0.5. https://CRAN.R-project.org/package=factoextra.
Konate I. 2007. Diversité phénotypique et moléculaire du caroubier (Ceratonia siliqua L.) et des bactéries qui lui sont Associées. Thèse de doctorat en Biotechnologie et biologie moléculaire. Université Mohammed V-AGDAL, Rabat, Maroc. 196 p.
Koussinou C, Adandonon A, Nodichao L. 2019. Distribution and incidence of Fusarium wilt in oil palm in Benin. Journal of Applied Biosciences 135: 13831 – 13839.
Lanteri S, Barcaccia G. 2005. Molecular markers based analysis for crop germplasm preservation. The role of Biotechnology, Villa Gualino, Turin, Italy, pp 55-66.
Le S, Josse J, Husson F. 2008. FactoMineR: An R package for multivariate analysis. Journal of Statistical Software 25(1) : 1-18.
Mares DJ, Marschner H. 1980. Assimilate conversion in potato tubers in relation to starch deposition and cell growth. Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft 93 : 299-313.
Martins SR, Vences FJ, Miera LE, Barrosa MR, Carnide V. 2006. RAPD analysis of genetic diversity among and within Portuguese landraces of common white Bean (Phaseolus vulgaris L.). Scientia Horticulturae 108(2) : 133-142.
Morineau A. 1984. Note sur la caractérisation statistique d'une classe et les valeurs-tests. Bulletin Technique du Centre de Statistique et d'Informatique Appliquées 2 : 20-27.
Noumouha EN, Allou G, Adon B, Konan JN, Diabate S, Konan KE, Nguetta S-PA. 2014. Assessment of nigerian wild oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) populations in crosses with Deli testers. Journal of Plant Breeding and Genetics 2: 77-86.
Nouy B, Baudouin L, Djégui N, Omoré A. 1999. Le palmier à huile en conditions hydriques limitantes. Plantations, Recherche, Développement, 6(1): 31-45.
Ntsomboh NG, Ngando-Ebongue GF, Koona P, Bell JM, Youmbi E, Ngalle-Bille H, Bilong EG, Madi G, Anaba B. 2012. Control approaches against vascular wilt disease of Elaeis guineensis Jacq. Caused by Fusarium oxysporum f. sp. elaeidis. Journal of Biology and Life Science 3: 160-173.
Prendergast AG. 1963. A method of testing oil palm progenies at the nursery stage for resistance to vascular wilt disease caused by Fusarium oxysporum. Palm Oil Research. 4 :156-175.
R Core Team. 2019. R : Un langage et un environnement pour l'informatique statistique. R Foundation for Statistical Computing, Vienne, Autriche. https://www.R-project.org/
Renard JL, Gascon JP, Bachy A. 1972. Recherches sur la fusariose du palmier à huile. Oléagineux 35 : 387-393.
Renard JL, Noiret JM, Meunier J. 1980. Sources et gammes de résistance à la fusariose chez le palmier à huile. Elaeis guineensis et Elaeis melanococca. Oléagineux 39(8-9) : 387-393.
Ruehl E, Konrad H, Lindner B. 2015. Conserving and utilizing intra-varietal variation in grapevines (Vitis vinifera L.) edpsciences. 38th World Congress of Vine and Wine.
Subroto AP, Utomo C, Darmawan C, Tanjung Z, Liwang T. 2014. Isolation and characterization of oil palm Wrinkled 1 (WRI1) Gene. Procedia Chemistry 14 : 40–46.
Taquet B. 1985. Les mécanismes physiologiques de la réaction de défense du palmier à huile contre la fusariose vasculaire. Application à la recherche de nouveaux moyens de lutte. Thèse de Doctorat : Université Pierre et Marie Curie- Paris. 164p.
Teshome H, Dechassa N, Tsegaw T. 2014. Morphological characters of potato (Solanum tuberosum L.) as influenced by local and improved cultivars grown in Eastern Ethiopia. Journal of Biology, Agriculture and Healthcare 4(17): 2225-093.
Wassu M. 2014. Genetic variability in potato (Solanum tuberosum L.) Genotypes for late blight [Phytophthora infestans (Mont.) de Bary] resistance and yield at Haramaya, Eastern Ethiopia. East African Journal of Sciences 8(1): 13-28.
Werij JS, Kloosterman B, Celis-Gamboa C, de Vos CH, America T, Visser RG, Bachem CW. 2007. Unravelling enzymatic discoloration in potato through a combined approach of candidate genes, QTL, and expression analysis. Theoretical and Applied Genetics 115(2): 245-252.
Downloads
Publiée
Comment citer
Numéro
Rubrique
Licence
Copyright (c) 2021 Sciences et Technologies pour l’Agriculture Durable
Ce travail est disponible sous licence Creative Commons Attribution - Partage dans les Mêmes Conditions 4.0 International.
COPYRIGTH CONSEIL SCIENTIFIQUE UNA 2021